看到你的描述真的很心疼，也完全理解你现在焦虑的心情。先抱抱你，确诊这个消息确实会让人一下子接受不了，夜里睡不着真的太正常了。
我在产前诊断门诊工作这么多年，接触过不少像你这样有外胚层发育不良情况的准妈妈。你问为什么同一个基因问题会同时影响牙齿和汗腺，其实可以这么理解：在胚胎早期发育的时候，外胚层就像是我们身体好多器官的“种子库”，牙齿、汗腺、毛发、甚至指甲都是由它分化出来的。如果这个阶段的某个基因（比如你提到的EDNA相关基因）出了点状况，就好像种子库的指令系统乱了，那么后续长出来的“小零件”就可能出现各种状况。所以牙齿稀少、汗腺功能不好这些表现，其实是同一个根源在不同地方的反应，它们不是独立的两个问题。
你特别担心的遗传概率问题，这个确实需要结合你的具体基因突变类型来分析。不同类型的遗传模式概率差别还挺大的，有的可能是50%，有的可能低一些。我建议你下次去医院的时候，专门挂一个遗传咨询门诊，让医生结合你的基因报告，给你画个清晰的家族遗传图谱，这样你自己心里会更踏实。我们科室也常建议这种情况的夫妻做胚胎植入前遗传学检测，就是大家常说的第三代试管婴儿，可以在怀孕前筛选一下。
不过这些方案的选择，真的需要你和家人、还有你的主治医生一起慢慢商量。每个人的具体情况都不一样，较终还是要以你就诊医院给到的专业意见为准。别给自己太大压力，你已经很勇敢了，一步步来，先把情况弄清楚，后面的事情我们慢慢面对。