看到你这么着急，连觉都睡不好，真的很心疼。癫痫症这个病本来就够折磨人的，现在还要为检查费用发愁，换谁都难受。
我在妇产科工作，虽然不直接看癫痫症，但确实接触过不少因为遗传问题来做产前诊断的患者。基因检测这块的费用问题，确实每个地方政策差别挺大的。
听你说的这个五六千的价格，差不多就是我们医院做二代测序的普遍价位。医保报销这块真的没有统一标准，有的省市把它纳入特殊病种报销范围，能报一部分；但很多地方还是完全自费的。我们医院上个月有个患者跟你情况类似，较后自费了四千多，他们当地政策算是比较好的。
我觉得你可以试试这几个方法：领先，让你主治医生帮忙开个"临床必要性证明"，有时候医保审核会参考这个；第二，直接去医保局窗口问，带上你的病历资料，他们给出的信息较权威；第三，可以问问医院有没有合作的研究项目，偶尔能减免部分费用。
不过说到底，具体能报多少，真的要以你当地医保政策为准。记得通常要跟神经内科主治医生充分沟通，毕竟他较了解你的病情是否需要做这个检测。别太焦虑，医保政策每年都在调整，说不定明年就有新变化呢。