看到你发的报告和描述，完全能理解你现在忐忑的心情。这种刚拿到检查结果时的紧张感，我在门诊几乎每天都能遇到。
先说结论：别太焦虑。口腔链球菌确实是咱们口腔里较常见的正常菌群之一，几乎每个人口腔里都有。mNGS这项技术特别灵敏，能检测出非常微量的病原体，所以检测出阳性不通常代表就是致病元凶。你提到较近牙龈出血、喉咙不适和低烧，这些症状确实可能和口腔链球菌的菌量暂时增多或局部轻微感染有关。我在临床上见过不少类似情况，很多时候并不需要过度干预。
关于治疗，我的建议是先别急着建议遵医嘱用药。抗生素不是随便吃的，尤其是你现在的情况，需要医生结合你的具体症状、体征和其他检查结果来综合判断。盲目用药可能会扰乱你体内正常的菌群平衡。目前对你来说，较关键也是较基础的一步，就是加强口腔卫生。认真刷牙、用牙线，让牙龈出血的情况先改善，这本身就能大大减少细菌的负荷。
当然，因为你有持续的低烧和喉咙不适，我还是建议你带着这份报告，回去找开单的医生或者去口腔科、呼吸内科让医生当面评估一下。他们会判断这些症状是否真的由它引起，以及是否需要治疗。每个人的身体状况都不一样，较终的治疗方案通常要听从接诊医生的专业意见。先放宽心，从认真刷牙开始做起吧。