HRD检测必须用新鲜肿瘤组织吗？手术石蜡块可以吗？
门诊来了一位复发性卵巢癌患者李女士。她的手术是三年前做的，当时病理科按常规流程将肿瘤组织制成了福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）块。如今，为了评估是否适合使用PARP抑制剂，需要进行HRD检测。面对她带来的陈旧手术蜡块，她和主治医生都产生了同样的疑问：HRD检测必须用新鲜肿瘤组织吗？手术石蜡块可以吗？ 这个问题的答案，直接关系到检测能否进行以及结果的可靠性。
新鲜组织与石蜡块在DNA保存质量上存在差异
要理解样本选择的重要性，得先看看它们是怎么来的。新鲜肿瘤组织，通常指手术中切下后，未经福尔马林固定，直接放入液氮或-80℃超低温冰箱速冻保存的组织。这种方式能最大程度地“冻结”细胞状态，DNA保持完整，降解最少，可以说是分子检测的“理想原料”。
而手术石蜡块，即FFPE样本，是病理诊断的“金标准”材料。流程是组织离体后，立即浸泡在福尔马林溶液中固定，再经过脱水、透明、浸蜡、包埋。问题就出在福尔马林固定这一步——它会引发DNA与蛋白质的交联，并导致DNA链的随机断裂。时间越长，这种损伤越严重。DNA片段化、碱基修饰（如C变为U）是FFPE样本的常见问题。HRD检测，尤其是基于下一代测序（NGS）评估基因组瘢痕（如LOH、TAI、LST）的方法，对DNA的质量和完整性有较高要求。因此，从理论上看，FFPE样本的DNA质量先天不足。
使用新鲜肿瘤组织进行HRD检测的优势何在
如果一切条件完美，新鲜肿瘤组织无疑是HRD检测的首选。它的DNA完整性高，片段长度长，能够提供最接近体内原始状态的遗传信息。使用这类样本进行NGS建库，成功率更高，数据质量更稳定，理论上能更精准地捕捉到基因组不稳定的细微模式，也就是HRD的“指纹”。
但理想很丰满，现实却很骨感！新鲜组织的获取和保存是一套复杂的系统工程。它要求手术室、病理科和检验科/分子实验室之间有无缝衔接的标准化操作流程（SOP）。手术中需要快速取样，立即冷冻，全程冷链运输至实验室。这不仅仅增加了医疗成本，更关键的是，在很多医疗机构，尤其是非大型肿瘤中心，这套流程并未常规建立。对于李女士这样的患者，手术已是三年前，当时根本没有预留新鲜组织，这条路就走不通了。所以，新鲜组织的“优势”常常被其“临床可及性低”所抵消。
福尔马林固定石蜡包埋组织可用于HRD检测
那么，回到最初的问题：HRD检测必须用新鲜肿瘤组织吗？手术石蜡块可以吗？ 答案是明确的：在现有成熟的技术条件下，经过严格质控和流程优化的FFPE手术石蜡块，完全可用于HRD检测，并且是当前临床实践中最主要、最常规的样本来源。
现代分子诊断实验室早已认识到FFPE样本的挑战，并发展出一整套应对方案。针对DNA交联和片段化，有专门的核酸提取试剂和修复酶；NGS建库环节，有针对短片段DNA优化的建库技术，能高效捕获有限的可测序片段；在生物信息学分析端，算法会进行校正和优化，以区分真正的基因组瘢痕信号与因样本降解引入的技术噪音。国内外已有多项临床研究证实，使用经过验证的NGS平台对FFPE样本进行HRD检测，其结果与使用新鲜组织样本具有高度的一致性，并能有效预测PARP抑制剂的疗效。
因此，问题的核心从“能不能用”转变为了“怎么用好”。关键在于选择经过大量临床样本验证、明确标明适用于FFPE样本的HRD检测产品和服务。实验室在接收样本前，会对石蜡块进行质控评估，比如通过HE染色评估肿瘤细胞含量（通常要求>20%），评估组织固定是否及时、固定时间是否过长等。一个质量合格的FFPE样本，其检测结果是值得信赖的。
为HRD检测选择合适样本的实践建议
面对具体患者，该如何决策呢？这里有一些基于临床经验的实用建议。
对于像李女士这样的绝大多数患者，已存档的手术石蜡块是首选的、也是最可行的检测材料。临床医生应优先调取原始手术或活检的蜡块进行检测。在送检前，与病理科沟通，确认蜡块中肿瘤区域丰富，并尽量提供近期（如3-5年内）的蜡块，以降低DNA降解的影响。
如果患者即将进行手术，且有明确的HRD检测需求，可以进行前瞻性规划。术前与病理科充分沟通，在保证病理诊断所需组织量的前提下，预留一部分新鲜肿瘤组织，按照实验室要求进行快速冷冻保存。这为获取最优检测样本提供了可能，尤其适用于一些对样本质量要求极高的复杂分析。
无论选择哪种样本，质量永远是第一位的。肿瘤细胞含量不足、组织固定不当（如固定液浓度错误、固定时间不足或过长）、蜡块存放时间过久（超过5-10年），都可能直接导致检测失败或结果不准。与经验丰富的检测实验室保持沟通，让他们参与样本评估，是确保检测成功的关键一步。
展望：样本类型的拓展与检测技术的革新
未来，HRD检测的样本选择可能会更加多元化。液体活检，即检测血液中的循环肿瘤DNA（ctDNA），在肿瘤复发监测和无法获取组织样本的患者中展现出巨大潜力。虽然目前基于ctDNA的HRD检测在技术上面临灵敏度（尤其是对基因组瘢痕信号）的挑战，但它无创、可重复取样的优势无可替代。随着测序深度增加和算法进步，其应用前景广阔。
另一方面，检测技术本身也在不断进化。单细胞测序、长读长测序等新技术，或许能更好地克服FFPE样本DNA片段化的问题，甚至能从更微量的样本中提取出更全面的基因组不稳定信息。同时，人工智能驱动的生物信息学分析，有望更精准地从“嘈杂”的FFPE数据中提取出真正的HRD信号。
回到李女士的案例，她的三年前手术石蜡块在经过实验室质控合格后，成功完成了HRD检测，结果为阳性，为她使用PARP抑制剂提供了有力的分子依据。这个案例生动地说明，HRD检测必须用新鲜肿瘤组织吗？手术石蜡块可以吗？ 答案是否定前者，肯定后者。在精准医疗的时代，充分理解不同样本的特性，在理想与现实之间找到最佳平衡点，才能让先进的检测技术真正惠及每一位患者。
